Здание дошкольного образовательного учреждения было построено Алтайским тракторным заводом. В январе 1993 года детский сад переведен в ведомство муниципалитета и 20.07.1993 года зарегистрирован в администрации города Рубцовска как «Муниципальное дошкольное образовательное учреждение «Ясли-сад №53 «Топтыжка», 30.12.1999 г. учреждение переименовано и зарегистрировано в администрации города как «Муниципальное дошкольное образовательное учреждение «Детский сад №53 «Топтыжка». Постановлением администрации города Рубцовска №3530 от 24.08.2011 г. учреждение переименовано в муниципальное бюджетное дошкольное образовательное учреждение «Центр развития ребенка-детский сад № 53 «Топтыжка».

Под руководством первой заведующей (Малахова Раиса Васильевна, Отличник народного просвещения) коллектив неоднократно становился призером городских конкурсов по озеленению и благоустройству территории учреждения, художественной самодеятельности.

С 1990 года детский сад возглавляла Папушева Ольга Николаевна (Почетный работник общего образования). В период экономического кризиса Ольга Николаевна сохранила детский сад, открыв на базе пустующих групп филиал начальной школы №24. Под ее руководством разработана система работы с учреждениями культурно-образовательного социума.

В 1984 году эстафету руководства приняла Любинская Наталья Анатольевна (Почетный работник общего образования), которая внесла большой вклад в развитие предметно-развивающей среды, организацию новых форм работы с воспитанниками, педагогами и учреждениями социальной сферы.

По проекту МБДОУ рассчитано на 265 мест. В настоящее время детский сад посещают 322 ребенка. С 15 мая 2013 года в учреждении функционирует 12 групп, созданы необходимые условия как для развития и оздоровления воспитанников, так и для профессионального роста педагогов.

Педагогами МБДОУ реализуются комплексные и парциальные программы нового поколения, активно внедряются здоровьесберегающие и информационно-коммуникативные технологии. На протяжении ряда лет учреждение является базовым для студентов педагогического колледжа города Рубцовска. Воспитанники МБДОУ являются лауреатами и призерами городских, региональных и всероссийских конкурсов, участвуют в фестивалях и олимпиадах.

МБДОУ «ЦРР-детский сад №53 «Топтыжка» – дипломант Региональной образовательной выставки «Реализация ПНПО как фактор развития региональной образовательной системы образования» (2009 г.), лауреат краевого конкурса «Детский сад Алтая-2012» в номинации «Лучшая работа учреждения дошкольного образования по организации интеграции деятельности с учреждениями дополнительного образования, учреждениями культуры, спорта и др.».